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近年來，阿勒泰地區持續加強野生動植物保護，生態環境顯著改善，野生動植物種群數量明顯增多。

根據監測數據顯示，目前，阿勒泰地區現有野生植物1378種，野生動物466種(獸類72種，鳥類355種，兩棲爬行類15種，魚類24種)。國家重點保護野生動物123種(一級保護野生動物31種，二級保護野生動物92種)。自治區重點保護野生動物40種（一級保護野生動物23種，二級保護野生動物17種）。

為切實做好野生動物保護工作，強化對蒙新河貍、普氏野馬、雪豹、遺鷗、蒙古野驢、鶴類等一批國家重點保護野生動物及棲息地的有效保護，促進鹽樺、蘭科植物等一批珍稀瀕危植物種群規模逐步恢復。

每年春秋候鳥遷徙期，印發《關于打擊亂捕濫獵和非法經營利用候鳥違法犯罪的通知》，切實做好候鳥保護工作。堅決革除濫食野生動物陋習，嚴厲打擊亂采濫挖國家重點保護野生植物、非法野生動物交易行為和涉野生動物違法犯罪行為。

為不斷提高社會公眾對保護鳥類、保護野生動植物的自覺意識。依托自然保護區、濕地公園及時建立了動植物標本館、科普館等宣教設施，發揮動植物保護民間社團組織作用，積極開展研學游等形式的普法宣傳活動。以“世界野生動植物日”“野生動物保護宣傳月”“愛鳥周”等宣傳活動為主要載體，通過制作和發放宣傳材料10000余份，利用網絡平臺向社會各界廣泛宣傳野生動物保護相關法律法規，收到良好效果。

依托野生動物疫源疫病監測項目資金，共建成國家級野生動物疫源疫病監測站4個，自治區級野生動物疫源疫病監測站10個，初步形成了點、面、網互聯互通和信息及時傳輸，覆蓋全地區的野生動物疫源疫病監測預警網絡體系，確保動物疫情能及時準確直達上報。監測設備正常使用，發揮作用，持續開展重點野生動物疫病野外監測預警工作。

全面加強野生動物人工繁育監管，將列入《國家畜禽遺傳資源目錄》的鴕鳥、馬鹿、梅花鹿、雉雞等移交農業農村部門管理，妥善處理禁食動物養殖戶有序轉產轉業。完善野生動物收容救護機制體制，依托各級野生動物保護管理部門、野生動物救護站點和馴養繁殖場，積極開展傷病野生動物救護工作，目前，共救護蒙新河貍、馬鹿、盤羊等野生動物31只，放歸3只。